Detektion av landminor med bakteriella biosensorer

Naturligt förekommande jordbakterier kan ställa om sin metabolism så att t ex. explosivämnesrelaterade substanser i jorden kan utgöra bakteriens näringskälla. När den organiska substansen från omgivningen (i detta fall DNT) kommer in i bakterien binds den till ett regulatorprotein (DntR), vilket orsakar en förändring i proteinets form och aktiverar detta. Under aktiveringen binds det till en specifik plats på DNA-matrisen i bakterien, vilket initierar inläsningsprocessen och resulterar i syntetisering av ett passande nedbrytningsenzym. I detta projekt har den DNAmatris som är ansvarig för syntes av nedbrytningsenzymet ersatts av en DNA-matris som kodar för ett grönt fluorescerande protein (GFP). När den modifierade bakterien exponeras för DNT syntetiseras GFP som sänder ut grönt ljus vid bestrålning med UV-ljus. Strukturen för regulatorproteinet (DntR) har bestämts och den organiska föreningen (DNT) som ska brytas ner binder till en specifik ficka i DntR. Känsligheten i fickan måste förändras så att DNT binder starkt och andra substrat binder mycket svagare. Detta sker med bl a modellering med olika substrat i bindningsfickan för att bestämma vilka aminosyrarester som måste bytas ut för att optimera bindningen för DNT.