PCR-provupparbetning för miljöprover

KBM finansierar som en del i beredskapen mot bioterrorism en ökad samordning av Sveriges myndighetslaboratorier. FOIs roll i detta sammanhang är att delta i myndighetsnätverket och bidra med metodutveckling och expertkunskap. En del i detta är denna rapport, som är en sammanställning av metoder för preparation av DNA och i vissa fall RNA från olika typer av miljöprover som pulver, jord, vatten, vegetation och ytor. Syftet med rapporten är att den ska utgöra ett underlag för kontinuerlig utveckling och uppdatering av dessa frågor inom nätverket Forum för beredskapsdiagnostik. De metoder som presenteras här är endast en del i en analysberedskap med fokus på miljöprover som i sin tur endast är en del av alla tänkbara provtyper som är sannolika i samband med bioterrorism. PCR måste dessutom alltid kompletteras med annan metodik som odling, biokemi, mikroskopi, immunologi och typningsmetoder för otvetydig identifiering av mikrobiella agens. PCR-analys kopplat med fungerande provupparbetningsmetoder är lämpligt att användas som snabb, initial screeningsmetodik i samband med bioterrorism, eftersom snabb information är särskilt avgörande för hantering av akuta krissituationer.